Des notebooks R plus reproductibles

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created: 2024-11-13

updated: 08:00:54 - November 12, 2024

Des notebooks R plus reproductibles

Journées GT Notebook 2024

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#R #reproductibilité

L’atelier

Organisation : Nicolas Roelandt, avec Sébastien R.C. & Hugues P.

Objectif·s : L’objectif de l’atelier est de mettre en oeuvre plusieurs outils de l’écosystème R permettant d’améliorer la reproductibilité computationelle de traitements de données

Durée : 2h

Méthodes : L’atelier repose sur le principe de …

Outils & librairies : Quarto, Renv, targets, …

Dépots git :

Déroulé de l’atelier

Cette section liste les étapes de l’atelier et indique les ressources nécessaires/disponibles pour chaque étape.

Étape 1: Anatomie d’un notebook Quarto
Étape 2: Renforcer les traitements avec targets
Étape 3: Gérer l’environnement logiciel avec Renv
Étape 4: Aller plus loin avec Docker

Prise de note

Cette section peut être utilisée librement comme espace d’organisation et de documentation pendant l’atelier.

Participants : ajoutez vos noms ici

Compte-rendu

Cette section est utilisée comme espace de consolidation : synthèse des réalisation, difficultés/freins rencontré·e·s, pistes pour la suite, autre…

Réalisations

Difficultés rencontrées

Pour aller plus loin